Кафедра болезней птиц, рыб, пчел и пушных зверей была организована в 1975 году при слиянии кафедры болезней птиц и промысловых животных и кафедры болезней пчел и рыб.

В Петроградском ветеринарно-зоотехническом институте кафедра болезней птиц и промысловых животных была создана в 1921 году, первым ее заведующим был профессор Конге Владимир Владимирович (1873-1942 гг.).

Владимир Владимирович родился в Санкт-Петербурге, окончил Юрьевский ветеринарный институт в 1898 году, работал ветеринарным врачом Дубровского конного завода, а затем с 1900 г. – участковым врачом Санкт-Петербурга. С 1901 по 1905 г. работал прозектором при кафедре нормальной анатомии домашних животных Юрьевского ветеринарного института (ныне г. Тарту). С 1905 по 1906 г. во время войны с Японией находился на военной службе. С 1906 г. работал участковым врачом в Петербурге, а с 1914 г. — старшим ветврачом 22-го армейского корпуса, а затем крепости Кронштадт. С 1918 г. работал участковым врачом в Московской области.

С 1921 г. (и в блокадном Ленинграде в 1942 г.) заведовал кафедрой болезней птиц и промысловых животных в ЛВИ.

В 1933 г. при кафедре была создана лаборатория по изучению болезней птиц, которую тоже возглавил проф. В.В. Конге. Вместе с ним на кафедре и в лаборатории работали ассистенты Михайлов А.В. и Сопиков П.М., научные сотрудники Пыжов Ф.Д., Дядькова А.М. и Рыжовская Л.И.

В этот период шла организация птицесовхозов, инкубаторно-птицеводческих станций и племенных птицехозяйств, была потребность как в подготовке специалистов по болезням птиц, так и в оказании практической помощи в ликвидации заболеваний в птицехозяйствах. Кафедра и лаборатория оказывали большую помощь в проведении этих мероприятий. По заданию министерства сельского хозяйства СССР, при кафедре были организованы и проводились курсы для ветврачей птицеводческих хозяйств, которые работали до 1970 г., а затем были переведены в ВНИИБП (ныне ВНИВИП).

Успешно велась и научно-исследовательская работа. На кафедре и в лаборатории под руководством проф. Конге В.В. изучались болезнь Марека (нейролимфоматоз), лейкоз и саркоматоз птиц, паратиф и другие сальмонеллезы. Была установлена инфекционная природа нейролимфоматоза, создана вакцина против паратифа водоплавающей птицы, исследовались патоморфологические изменения при лейкозе и саркоматозе птиц, разрабатывались методы диагностики этих болезней. Одним из учеников профессора Конге В.В. и его соратником был профессор Сопиков Петр Михайлович (1903-1977 гг.). Петр Михайлович в 1930 г. окончил ЛВИ, с 1933 г. работал ассистентом кафедры болезней птиц и промысловых животных. Под руководством проф. Конге В.В. выполнил научную работу по изучению паратифа утят и гусят и в 1936 г. по её результатам защитил кандидатскую диссертацию. С 1945 г. возглавлял кафедру болезней птиц в ЛИУВВ, а после его слияния с ЛВИ в 1958 г. — кафедру болезней птиц и промысловых животных. Педагогическую работу на кафедре в эти годы вели доц. Голикова Е.М., ассистенты В.Ф. Адаманис, Н.В. Титова, К.П. Романов. За этот период сотрудниками кафедры было опубликовано 56 научных работ.
В 1953 г. П.М. Сопиков написал учебник по болезням птиц, который явился одной из первых оригинальных работ такого рода в отечественной литературе. Для четырех изданий «Справочника ветеринарного врача» им написаны разделы «Инфекционные болезни птиц». Более 30 лет своей научной деятельности проф. Сопиков П.М. посвятил изучению проблемы гемогибридизации птиц и выведению этим методом новой породы кур, названной им «Ленинградская белая». Для выполнения этих задач была преобразована лаборатория болезней птиц. С 1961 г. в Проблемной лаборатории гемотканевой гибридизации над новым методом изменения наследственности у птиц рабтали научные сотрудники: Абрамова Е.Н., Бочарова И.Г., Васильева Г.С., Кондратьева М.А., Каравашкина Л.В., Соколова Л.Н., которые вели селекционную работу по совершенствованию мясной скороспелости ленинградских белых кур. Результаты исследований регулярно публиковались в научной периодической печати и были доложены на XI и XIII Всемирных конгрессах по птицеводству в 1958 г. в Мексике и в 1966 г. в СССР. За эти годы под руководством проф. Сопикова П.М. окончили аспирантуру и защитили диссертации Виноходов О.В., Котляков Д.А., Федоров В.П., Палевич В.С. и Л.Н. Соколова.

С 1974 г. кафедрой болезней птиц и промысловых животных заведовала доцент Голикова Евгения Моисеевна. В 1946 г. закончила МВИ, а затем и аспирантуру при кафедре патологической анатомии МВА. В ЛВИ работала с 1958 г. ассистентом, а затем доцентом кафедры болезней птиц, опубликовала свыше 30 научных работ, имеющих научную и практическую ценность по различным аспектам патологии птиц и пушных зверей. Наиболее важными в практическом значении были работы по влиянию на поствакцинальный иммунитет птицы витаминов А и С и использованию гистологического метода определения витамина С в тканях.
Кафедра болезней рыб и пчел была создана в 1958 году, ее организатором был профессор Василий Иванович Полтев. Однако еще задолго до ее создания в институте проводилась большая научно-исследовательская работа по изучению болезней пчел и подготовке специалистов в этой области. Обобщая данные науки и практики отечественных и зарубежных исследователей, В.И. Полтев написал первый в Советском Союзе учебник «Болезни пчел», который вышел в свет в 1929 году. Последующие три издания этой книги, а также многочисленные научные труды В.И. Полтева, признанные специалистами разных стран, и легли в основу формирования развития науки о патологии пчелиной семьи, разработки мер борьбы и профилактики болезней пчел. Под руководством проф. Полтева В.И. подготовлено много специалистов, научных работников. В том числе был и Петр Петрович Мышкин, который в течение долгих лет работал в Ленинградском ветеринарном институте и в Ленинградском институте усовершенствования ветеринарных врачей. Именно П.П. Мышкин начал подготовку будущих ветеринарных врачей по курсу «Болезней пчел», который читался студентам факультативно с 1939 года.
Создание курса «Болезни рыб» было также весьма своевременным. Интенсивное развитие прудового рыболовства, преобразование огромных водных массивов нашей страны, многочисленные перевозки рыбы с целью ее акклиматизации в различных географических зонах потребовали ветеринарного надзора и проведения жестких мероприятий с целью предотвращения массовых вспышек инвазионных и инфекционных болезней рыб. В нашей стране началась подготовка ветеринарных врачей по ихтиопатологии. В организации курса по болезням рыб большую работу выполнила Нина Всеволодовна Гусева.
Таким образом, труды и методические разработки проф. Полтева В.И., доц. П.П. Мышкина и Н.В. Гусевой и легли в основу организации единственной в то время в стране кафедры болезней пчел и рыб. Эту кафедру до 1961 г. возглавлял доц. П.П. Мышкин, в 1961-1965 гг. — доц. Н.В. Гусева, а затем доц. В.А. Триленко. На кафедре работали доценты Гаврилов Б.Н. и Семенова Н.В.
С начала организации кафедры проводится подготовка студентов и ветеринарных врачей по курсам болезней рыб и пчел, а также работают курсы по подготовке ихтиопатологов. Для работы на этих курсах привлекаются видные ученые в области ихтиологии и ихтиопатологии из зоологического института Академии наук и ГОСНИОРХа. Так, в разное время на курсах ихтиопатологов преподавали проф. Бауэр О.Н., ст.н.с. Иоффе Ц.И., Аршаница Н.М., Юнчис О.Н. и др.
Кафедра проводила и значительную исследовательскую работу по изучению инвазионных болезней рыб — в частности диплостомоза и хилодонелеза рыб, выяснению этиологии жаберной гнили в прудовых хозяйствах, по изучению нозематоза и варрооза пчел, совершенствования методов дезинфекции при нозематозе. Сотрудники кафедры имели постоянную связь и оказывали помощь хозяйствам Ленинградской, Псковской, Новгородской и др. областей, Красноярскому, Хабаровскому и Приморскому краям, Карельский АССР, Грузинский ССР.
Доц. Гаврилов Б.Н. и ассистент Лудинова И.С. изучали особенности инвазионных болезней пчел (нозематоза и варроза) в условиях промышленного пчеловодства, разработали и внедрили новые высоко эффективные средства борьбы с варроозом. А также разрабатывали технологию промышленного пчеловодства на основе использования искусственного корма для пчел, состав которого ими был разработан.
На кафедре болезней птиц, рыб, пчел и пушных зверей обучаются студенты всех факультетов по болезням птиц и болезням рыб. При кафедре работают курсы по подготовке ихтиопатологов.

Сотрудники кафедры аквакультуры болезней птиц, рыб оказывают консультативную и практическую помощь по болезням аквариумных рыб, декоративных и певчих птиц, кроликов, нутрий и фреток, ведут лекционную и консультативную работу в Ленинградском клубе птицеводов-любите­лей, городских объединениях кролиководов и пчеловодов. Кафедра постоянно поддерживает тесную связь с птицеводческими комплексами и фермерами Ленинградской, Псковской, Новгородской, Ор­ловской, Липецкой областей, Донецкой и Днепропетровской областями Украины, помогая решать практические задачи совершенствования мероприятий по охране здоровья птиц в промышленных ком­плексах, организации и совершенствованию ветеринарного обслуживания фермерских хозяйств по разведению птицы, кроликов, пушных зверей и пчел. На кафедре разработаны программы по обуче­нию фермеров и любителей основам птице­водства, кролиководства, рыболовства и пчеловодства. Для студентов ветеринарно­го факультета организован факультатив по болезням декоративной и певчей птицы, кро­ликов, декоративных грызунов.

При кафедре имеется обширный музей, отражающий все разделы программ курсов болезней птиц, пушных зверей, кроликов, рыб и пчел. Музей состоит из макро- и мик­ропрепаратов, созданных сотрудниками ка­федры в разные годы, постоянно пополня­ется и обновляется.

Научные исследования кафедры тесно связаны с задачами промышленного птицеводства, зверо­водства, пчеловодства и рыбоводства и направлены на создание и усовершенствование профилактичес­ких мероприятий в промышленном птицеводстве и звероводстве, на создание и усовершенствование методов промышленного пчеловодства. В течение ряда лет выполняется научная работа по изучению и формированию иммунитета и механизмов естественной резистентности у бройлеров, совершенствова­нию лечебно-профилактических мероприятий в бройлерном птицеводстве при респираторных и кишеч­ных инфекциях. Сотрудники кафедры принимают участие в разработке и внедрении новых лекарствен­ных биопрепаратов для промышленного птицеводства. С 1986 г. на кафедре проводилась работа по усовершенствованию технологии производства и внедрению АТП (агаро-тканевого препарата) для сти­муляции роста, развития и повышения устойчивости организма птицы; изучался лечебно-профилакти­ческий эффект биофарма и новых комплексных сульфаниламидных препаратов при респираторных ин­фекциях бройлеров; исследовались сочетания антимикробных препаратов и биостимуляторов для повы­шения эффективности вакцинации бройлеров против колибактериоза. Сотрудники кафедры с 1979 г. принимали участие в создании технологии микробиологического синтеза витамина Д, в результате этих исследований создан и внедрен препарат «ВД-витаминные дрожжи» (кормовой препарат витамина Д3), изучены биологические свойства продуцента витамина Д3, а также биологические и токсикологические свойства нового препарата витамина Д3 и способы его применения в птицеводстве. Значительное внима­ние уделяется изучению иммуномодуляторов и индукторов интерферона для повышения эффективности вакцинаций в промышленном птицеводстве. С 1996 г. изучаются особенности формирования микроби­оценозов кишечника у птиц разного возраста и влияния на организм птицы пробиотиков на основе лакто- и бифидобактерий и полифепана. На основании этих исследований создается и совершенствуется система профилактики нарушений обмена веществ птицы в промышленном птицеводстве. С 1991 г. на кафедре ведутся исследования причины механизмов развития токсикозов печени у норок и других зве­рей, по подбору эффективных средств для профилактики нарушений обмена веществ пушных зверей. С этой целью изучается влияние липоевой кислоты и ее препаратов, метилурацила на синтетическую фун­кцию печени и обмена веществ у норок. Научно-исследовательскую работу по этим направлениям ведут проф. Соколова Л.Н., ст. преподаватели Сорокина Г.В., Печенкина А.А., аспирант Дмитриева М.Е., а также студенты — сновцы. Профессор Воронин В.Н., ассистенты Андреева А.А. и Доронин М.В. выполняют исследования по болезням прудовых и аквариумных рыб, поиску новых ангельминтиков и препаратов для лечения протозоонозов. Ассистент Мелентьев О.Н. изучает особенности проявления микозов плотоядных.

Результаты научно-исследовательской работы сотрудников кафедры регулярно публикуются не только в сборниках научных трудов академии, но и в журналах «Птицеводство», «Рыбоводство», «Ветеринария», «Сельскохозяйственная биология», «Ветеринария в птицеводстве», «Архив ветери­нарных наук», «Международный вестник ветеринарии» и других, докладываются на научных и науч­но-производственных конференциях различного уровня.

Результаты научных исследований кафедры по изучению нарушений обмена веществ у птиц и пушных зверей были использованы при создании препаратов для профилактики и лечения нарушений минерально­го и витаминного обмена у птиц, пушных зверей, собак и кошек. Препараты были разработаны в содруже­стве с ООО «Эксперимент» С.-Петербурга, где они и производятся. Наиболее известны среди них такие как «Кальцефит», «Альговит», «Микровит», белково-витаминная добавка для собак и минерально-вита­минная добавка для птиц. Разработаны и используются в практике «Временное наставление по примене­нию пробиотика на основе L.acidophilusдля птиц и пушных зверей», а также наставления по применению полифепана, для профилактики микотоксикозов в промышленном птицеводстве.

Объединённую кафедру болезней рыб, пчёл, птиц и пушных зверей с 1978 г. возглавлял доцент Гаврилов Б.Н. (1923 г.р.), а с 1985 г. — проф. Соколов В.Д. (1932 г.р.). В этот период на кафедре вели педагогическую и научно-исследовательскую работу доценты: Голикова Е.М., Триленко В.А., Семёнова Н.В., Гаврилов Б.Н., Крылов О.Н, Никитин Г.И.; старший преподаватель Романов К.П.; ассистенты: Соколова Л.Н., Дорутин А.С, Лудинова И.С. и Е.В. Антонова.

С 1986 г. по 2014 г. кафедрой заведовала профессор Соколова Лидия Николаевна (1949 г.р.), которая в 1971 г. окончила ЛВИ, затем в 1974 г. – аспирантуру при кафедре болезней птиц и промысловых. С 1975 г. работала младшим, а затем и старшим научным сотрудником в лаборатории гемогибридизации при кафедре болезней птиц, а в 1978 г. была переведена ассистентом на объединенную кафедру болезней рыб, пчел, птиц и пушных зверей. Л.Н. Соколовой выполнено и опубликовано 84 работы. Большая часть из них посвящена изучению влияния витамина Д и его различных источников на организм птицы, минеральный и витаминный обмен, иммунобиологическую реактивность организма птицы. По материалам этих работ получено 3 авторских свидетельства и патент, в 1998 г. защищена докторская диссертация. Соколова Л.Н. является соавтором трех учебников и одной монографии.

1 сентября 2017 г. кафедра была переименована в кафедру аквакультуры и болезней рыб.

В настоящее время коллектив кафедры состоит из заведующего кафедрой Кузнецовой Е.В. (к.б.н.), профессоров Воронина В.Н.(д.б.н.) и Лукина А.А. (д.б.н.), доцентов Мосягиной М.В.(к.б.н.) и Костромина Е.А. (к.б.н.), ассистентов Печенкиной А.А. и Кудрявцевой Т.М.
На кафедре аквакультуры и болезней рыб обучаются студенты трех факультетов аквакультуре и болезням рыб, пчёл и пушных зверей.
Сотрудники кафедры аквакультуры и болезней рыб оказывают консультативную и практическую помощь по болезням выращиваемых и аквариумных рыб, декоративных птиц, кроликов, нутрий и пчёл. Кафедра постоянно поддерживает тесную связь с рыбоводными хозяйствами Северо-Запада. При кафедре имеется обширный музей, отражающий все разделы обучения болезней рыб, пушных зверей, кроликов и пчел. Музей состоит из макро- и мик­ропрепаратов, созданных сотрудниками ка­федры в разные годы, постоянно пополня­ется и обновляется.
Результаты научно-исследовательской работы сотрудников кафедры регулярно публикуются не только в сборниках научных трудов академии, но и в журналах «Рыбоводство», «Ветеринария», «Международный вестник ветеринарии» и других, докладываются на научных и науч­но-производственных конференциях различного уровня.